2018/10/19 10:31:25作者:佚名来源:网络
DnaMan是由美国LynnonBiosoft公司推出的一款高度集成化的分子生物学应用软件,对于初学者来说使用起来可能会有些困难,下面分享一个DnaMan使用教程,不知道怎么使用的朋友可以参照下述教程操作,一起来看看吧!
一、将待分析序列装入Channel
1.通过File|Open 命令打开待分析序列文件,则打开的序列自动装入默认Channel。(初始为 channel1)可以通过激活不同的channel(例如:channel5)来改变序列装入的Channel2.通过Sequence|Load Sequence 菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel。
可以通过Sequence|Current Sequence|Analysis Defination 命令打开一个对话框,通过此对话框可以设定序列的性质(DNA 或蛋白质),名称,要分析的片段等参数
二、以不同形式显示序列
1.通过Sequence|Display Sequence 命令打开对话框
2.根据不同的需要,可以选择显示不同的序列转换形式,可选择:
1)显示序列和成分
2)显示待分析序列的反向序列
3)显示待分析序列的反向互补序列
4)显示待分析序列的互补序列
5)显示待分析序列的双链序列
6)显示待分析序列的对应RNA序列
3.参数说明如下
Results 分析结果显示
其中包括:Show summary(显示概要) Show sites on sequence(在结果中显示酶切位点)
Draw restriction map(显示限制性酶切图)Draw restriction pattern(显示限制性酶切模式图)
Ignore enzymes with more than(忽略大于某设定值的酶切位点)
Ignore enzymes with less than(忽略小于某设定值的酶切位点)
Target DNA (目标DNA 特性)
circular(环型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)all DNA in Sequence Channel(选择此项,在Sequence Channel 中的所有序列将被分析, 如果选择了Draw restriction pattern,那么当所有的channel 中共有两条DNA 时,则只能选择两个酶分析,如果共有三个以上DNA 时,则只能用一个酶分析。
三、序列同源性分析
1)两序列同源性分析
1.通过Sequence|Two Sequence Alignment 命令打开对话框
2.参数说明如下
Alignment method 比对方法,通常可选Quick(快速比对)或Smith&Waterman(最佳比对),当选择快速比对时,设置较小的k-tuple 值,可以提高精确度,当序列较长时,一般要设置较大的k-tuple 值。(dna 序列:k-tuple 值可选范围2—6;蛋白质序列:k-tuple 值可选范围1—3
2)多序列同源性分析
1.通过打开Sequence|Multiple Sequence Alignment 命令打开对话框
2.参数说明如下
a.从文件中选择参加比对的序列
b.从文件夹中选择参加比对的序列
c.从channel 中选择参加比对的序列
d.从数据库中选择参加比对的序列
e.清除选择的序列(鼠标点击左边显示框中的序列名选择)
f.清除全部序列
标签: DnaMan DnaMan使用教程 DnaMan使用说明
相关文章
ip雷达 v5.0.2绿色版
详情WinSCPv5.15.1绿色中文版
详情filezilla client v5.5
详情wireshark中文版 v3.4.9
详情Boson Netsimv10.8
详情风行播放器 v3.0.6.106
详情爱奇艺客户端 v10.1.0.6636官方版
详情搜狐影音 v7.0.19.0官方版
详情乐视视频 v7.3.2.192
详情华数tv客户端PC版 v1.1.2.0
详情cbox央视影音 v5.1.2.1经典版
详情软媒收音机(魔方) v1.13
详情倾听网络收音机 v3.0.0.0
详情魅影流声全球网络收音机 v1.0.0.1
详情酷狗电台 v8.2.75
详情暴龙网络收音机 v2.5.1
详情克莉2v1.0中文版
详情冬日计划v1.2中文版
详情刺客信条英灵殿v1.0吾爱
详情刺客信条英灵殿终极v1.0免安装
详情动物森友会v1.10.0最新
详情哈迪斯杀出地狱v1.37中文
详情嗜血印中文豪华版v1.0豪华版 附游戏攻略秘籍
详情城市战斗v1.0中文
详情尼尔人工生命v1.0steam免费
详情尼尔人工生命升级版v1.0PC
详情层层恐惧2中文v1.0绿色免安装版
详情往日不再v1.0 steam
详情往日不再v1.0pc
详情救赎之路v1.0中文
详情斯盖尔女仆v1.0中文
详情月风魔传不死之月v1.0中文
详情speedtest测速appv5.0.9安卓版
详情小度音箱appv4.13.0.100安卓版
详情pubgtool画质助手安卓版v1.0.7.8安卓版
详情怪谈之家正版官方版v2.9.40安卓版
详情智慧中小学免费教育平台appv6.7.9安卓版
详情智慧中小学网课免费平台appv6.7.9安卓版
详情光环助手游戏盒v5.29.2安卓版
详情腾讯先锋官方正版v5.4.1.3989905安卓版
详情崩坏3星穹铁道v6.9.0安卓版
详情gg修改器中文版v0.1.9安卓版
详情易车网appv10.95.1安卓版
详情迷你世界最新版v1.28.6安卓版
详情太空行动体验服v1.44.11.001安卓版
详情qooapp正版v8.3.31安卓版
详情我养你啊游戏v1.0.0安卓版
详情remini照片修复v3.7.327.202255164安卓版
详情