ImageJ是一款基于java的图像分析软件。该软件可以进行显示、编辑、分析、处理、保存和打印8位、16位和32位图像。具体可应用于细胞计数masson染色，茜素红染色，鼠脑切片的梗塞区域面积的计算，血管分析，三维及多维图像的分析及其可视化等形态学分析。目前支持的图像格式包括TIFF，GIF，JPEG，BMP，DICOM，FITS和RAW等多种图像格式。并且软件不受操作系统的限制，官方发布了windows，linux以及mac不同操作系统的版本，小编带来的是Windows版本，需要的朋友可来本站下载。
软件特色
1、支持多平台：软件是用Java编写的，它允许它在32位和64位模式下在Linux，Mac OS X和Windows上运行。
2、开源：
软件及其 Java源代码 在公有领域免费提供 。不需要许可证
3、用户社区：
软件拥有一个庞大且知识渊博的全球用户社区。超过1700位用户和开发人员订阅了邮件列表。
4、宏：
使用宏自动化任务并创建自定义工具 。使用命令记录器生成宏代码， 并使用 宏调试器进行调试。 ImageJ网站上提供了300多个宏 。
5、插件：
通过使用软件内置的
文本编辑器和Java编译器开发插件来扩展ImageJ。有超过500个插件可用。
6、工具包：
使用软件作为图像处理工具包（类库）来开发 applet，servlet或应用程序。
7、速度：
软件是世界上最快的纯Java图像处理程序。它可以在0.1秒（*）中过滤2048x2048图像。这是每秒4000万像素！
8、数据类型：
8位灰度或索引颜色，16位无符号整数，32位浮点和RGB颜色。
9、文件格式：
将所有支持的数据类型打开并保存为TIFF（未压缩）或原始数据。打开并保存GIF，JPEG，BMP，PNG，PGM，FITS和ASCII。打开DICOM。使用URL打开TIFF，GIF，JPEG，DICOM和原始数据。使用插件打开并保存许多其他格式 。
10、图像显示：
提供了缩放工具（1:32到32：1）和滚动图像。所有分析和处理功能均可以任何放大系数工作。
11、选择：
创建矩形，椭圆形或不规则区域选择。创建线和点选择。编辑选择并使用魔杖工具自动创建它们。绘制，填充，清除，过滤或测量选择。保存选择并将其转移到其他图像。
12、图像增强：
支持8位灰度和RGB彩色图像的平滑，锐化，边缘检测，中值滤波和阈值处理。交互调整8、16和32位图像的亮度和对比度。
13、几何操作：
裁剪，缩放，调整大小并旋转。垂直或水平翻转。
14、分析：
测量面积，平均值，标准偏差，最小和最大选择或整个图像。测量长度和角度。使用真实世界的测量单位，如毫米。使用密度标准校准。生成直方图和轮廓图。
15、编辑：
剪切，复制或粘贴图像或选择。使用AND，OR，XOR或“Blend”模式进行粘贴。向图像添加文本，箭头，矩形，椭圆或多边形。
16、颜色处理：
将32位彩色图像分割成RGB或HSV组件。将8位组件合并成彩色图像。将RGB图像转换为8位索引颜色。将伪调色板应用于灰度图像。
17、栈：
在单个窗口中显示相关图像的“堆叠”。使用单个命令处理整个堆栈。打开图像文件夹作为堆栈。将堆栈保存为多图像TIFF文件。
更新日志
imagej 1.51更新：
1、在ROI管理器中添加超级投资回报率时，如果显示模式为“复合”，则通道位置设置为0（在所有通道中显示）。
2、添加了setOption（“ConvertToMicrons”，boolean）宏函数。设置此选项时，如果像素宽度小于0.0001厘米，TIFF图像中的单位将转换为微米。
3、修复了一个错误，导致使用“＆”符号传递变量的宏失败，如果他们使用 Process> Math> Macro命令来处理堆栈。
4、修正了1.51o的回归，有时在打开或处理图像时有时会导致软件冻结在Windows上。
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